随后，赵云任命沮授为幽州刺史，公孙瓒为征虏将军，率兵2万镇守并治理幽州；
将辽东、三韩、高句丽、扶余、挹娄合并为辽州，任命华歆为辽州刺史，颜良为镇军将军，率兵2万镇守并治理辽州，并伺机向北方扩张；
将幽州以北新征战的鲜卑、乌桓等地划为蒙州，任命任嘏为蒙州刺史，麯义为镇护将军，率兵3万镇守并治理蒙州，并伺机向北方扩张；
任命田丰为并州刺史，张燕为安众将军，率兵3万镇守并治理并州，并为向南方的司隶扩张做准备；
任命贾诩为凉州刺史，关羽为安远将军，文丑为安夷将军，张郃为飞西将军，率兵9万镇守并治理凉州，等到边章叛乱，韩遂杀害边章之时，就可以出兵除掉韩遂，拉拢收编马腾，伺机图谋汉中，向西探查西北都护府的所有消息；
其余的人也都得到了封赏。各州整合边军和各部兵马进行统一训练，以骑兵为主，并为骑兵快速打造马镫，马鞍。
各州刺史都可以去文学院和武学院挑选适合的人才在地方任职。
赵云派韩当从右北平通过海河向东阿县和朐县分别运送2万套的甲胄弓弩兵器战马。
在接下来的一个月里，举办了文武大赛，吕布没有参加，赵云在文武大赛中都取得了第一名，武将中关羽第二，典韦第三。由于诗文大赛赵云做出了十几首惊艳的诗词，其他人等再也不敢做诗了。从此天下人无人不知赵云。
184年3月5日，黄巾起义爆发了，这场起义是由张角领导的，他以“苍天已死，黄天当立，岁在甲子，天下大吉”为口号，发动了反对东汉朝廷的起义。
起义军头绑黄巾，因此被称为“黄巾军”。黄巾起义是中国历史上规模最大的一次宗教形式组织的民变之一，对东汉末年的政局产生了深远的影响。
朝廷发布让各地自己招兵镇压叛乱，赵云吩咐各处接收流民，并顺势占领整个翼州各郡。期间去各处搜集粮种的队伍相继回来，带来了土豆、玉米、红薯、辣椒、烟叶等种子。
现在正是耕种的时间，赵云命令韩浩、枣祗、杜畿三人速速找最肥沃的土地种植，今年可以种两茬。
中平元年（184年）冬，边章、韩随两人，在陇右叛乱。凉州刺史贾诩派关羽率军驻守阿阳县，边章等人见阿阳县无法攻破，便转向攻打金城郡，斩杀金城太守陈懿，攻烧州郡。经过关羽驱赶，他们一路向长安抢掠而去。
185年，赵云又命荀攸为军师，张飞、张任、典韦、高览、吴懿五位为大将，率领骑兵6万，飞天军5千，快速前往西北都护府，平定整个西域，政策和之前一样。
同年，贾诩命关羽突袭韩遂，并斩杀韩遂，收编马腾。控制了整个凉州。
186-187年，贾诩命张郃文丑灭了羌唐，占领庭布，至此整个西南高原皆纳入版图。女人全部分给士卒，将领，男人全部为奴，10岁以下孩童全部上学。文学院的学生学习三年的，都去各地兴办的学校教书。将西南地区命名为藏州。
荀攸平定了整个西域，赵云改西北都护府为域州，命钟繇为西域刺史，吴懿为平寇将军、高览为平虏将军镇守经略西域，继续攻占乌孙，康居、大月、天竺。
荀攸、张飞、张任、典韦押送无数珍宝，宝马，马种返回凉州，在凉州休整。伺机和贾诩占领汉中。
189年汉灵帝刘宏驾崩，汉少帝刘辩继位，十常侍杀死大将军何进，董卓进京诛杀十常侍，废刘辩立刘协为帝。封赵云为大将军。期间朝廷圣旨赵云一概不奉诏。唯独领了大将军。
通过6年的发展，幽州，辽州，常山等地，修建的水泥路相互联通，总计接收流民600万之多，赵云实际掌控的地区人口总数量达到1700万，粮食充足，百姓家家有地，人人有工作，有收入，低税负，到处安居乐业。截至目前仍然有无数百姓争相朝冀州幽州涌来。
文学院与武院共同培养了数千名人才，他们均在各地担任重要的地方职务。
现有总兵力达100万，其中边军30万，水军10万，骑兵40万，飞天军10万，弩兵5万，炮兵5万，并拥有海船百余艘。
赵云相继与蔡琰、吴苋、貂蝉、甄姜喜结良缘，蔡琰为赵云诞下一子，命名为赵统；吴苋则生下一女，取名赵悦；貂蝉已怀孕三个月；而甄姜则是新婚燕尔。
年底，赵云收到曹操的邀请，共同讨伐董卓。于是，赵云调集了10万骑兵，1万飞天军，1万弩兵，1万炮兵，3万水军，共计16万大军。他并未向酸枣县进发，而是选择在河内郡集结部队，并通过水路运输粮草至该地。
此次随行的武将包括许褚、裴元绍、程普、韩当、乐进、黄忠、太史慈七人；文臣则有郭嘉、荀彧、蒯越、徐庶、戏志才、程昱、陈宫七人。
190年正月，其他16路诸侯听闻大将军赵云在河内郡调兵遣将，纷纷前来询问会盟地点。赵云通知他们齐聚怀县、卷县。
此时只剩下17路诸侯，公孙瓒和马腾已不复存在，取而代之的是势力强大的赵云。翼州刺史韩馥和渤海太守袁绍虽名义上仍在其位，但实际上翼州的真正掌控者已是赵云。
其余17路诸侯不约而同地来到怀县赵云的帅帐中，拜见大将军赵云。袁绍提议应推举一位盟主，赵云则表示袁绍出身四世三公，应当担任此职。
然而，袁术却斥责袁绍，认为大将军赵云开疆扩土，功勋卓著，袁绍不配在其面前称盟主，曹操也附议，认为盟主非大将军莫属。在场众人均表示赞同。赵云询问袁绍的意见，袁绍尴尬不已，只得连连点头赞同。
随后，刘备带着管亥和廖化三人前来会盟。赵云将他们安置在自己的帐下，并命人严加看管，不得离开营地半步，否则格杀勿论。
赵云未再推辞盟主之位，开始询问众人讨伐董卓的策略。在听取了各路诸侯的意见后，赵云提出了自己的见解，表示各路兵马的粮草将由他出资补充。
他主张直接攻打虎牢关，尽管众人认为虎牢关难以攻克，赵云却自信满满地表示随时可以攻下。他强调兵贵神速，进军路上不得扰民、抢掠百姓或掠夺物资财物，攻克虎牢关后，将直取洛阳。
接着，赵云命令郭嘉、程昱、蒯越、陈宫、程普、韩当、裴元绍、乐进八人，率3万水军、5000炮兵、5000飞天军、5000弩兵，占领孟津港、新丰港、函谷关、潼关，以封锁董卓的逃跑路线。
不久，华雄前来挑战，连斩鲍忠、祖茂、俞涉、潘凤四将。赵云派黄忠出战，黄忠在十个回合后俘虏了华雄。
赵云询问华雄是否愿意归顺，华雄表示若赵云能战胜他，便愿意归顺。赵云随即应战，华雄在赵云的龙胆亮银枪下，一个回合都未能抵挡，便败下阵来。华雄跪地拜赵云为主公。
22岁的赵云，每日坚持不懈地修炼武艺，尤其注重力量的锻炼，力量和截击枪法已臻至登峰造极的境界。
三日后，其余兵马向汜水关进发。正当众人准备攻打汜水关时，吕布骑着赤兔马、手持方天画戟前来挑战。许褚、黄忠欲出战，赵云拦住了他们，亲自上阵。
赵云与吕布大战三十回合，吕布已是大汗淋漓，而赵云却显得轻松自如。吕布借助赤兔马的力量，全力一戟刺向赵云，赵云侧身一闪，同时一枪刺出，巧妙地躲过攻击，并洞穿了吕布的喉咙。
吕布挂在赵云的龙胆亮银枪上，赤兔马前行几丈后停下，旁边是吕布掉落的方天画戟。赵云返回营地，赤兔马跟随马王一同前行。
赵云的随从迅速上前取走吕布的尸体，并捡起方天画戟。赵云将赤兔马赐予黄忠，方天画戟赐予许褚，随即命令炮兵准备轰击汜水关城门和城墙。
实际上，只需炸药包即可轻松炸开城门，但为了震慑其他诸侯，赵云决定使用炮轰。
董卓在汜水关上向赵云喊话：“子龙，我一直都很佩服你，我做了相国，便分你为大将军，你为何同这些臭鱼烂虾一起来反？”
“董相国，你这话的意思是我反谁了？”赵云问董卓。
“你既是反咋家，也是反大汉。”董卓道。
“你是所有人认可的相国吗？你看看这些诸侯们，谁认你？皇帝是大汉的象征，你挟持天子，我们是来救天子的，所以我们是讨伐你，救大汉。”赵云道。
“咋家有10万大军，有汜水关天堑，你们如何讨伐咋家？”董卓道。
“我实话告诉你，我已经占领了孟津港、新丰港、函谷关、潼关，你没有后路了，还有这汜水关我弹指间就可破。”赵云道。